O Programa de Pós-Graduação em Bioquímica e Bioprospecção (PPGBBio) em nível de mestrado foi aprovado pela CAPES em dezembro de 2010 e teve o início de suas atividades em abril de 2011. A criação do referido programa teve como objetivo principal permitir uma maior aproximação da universidade com o setor produtivo, onde concentra suas pesquisas nas áreas de bioensaios, toxicologia e bioprospecção de substâncias sintéticas, semi-sintéticas e naturais. Em consonância com a formação pessoal, o PPGBBio visa atender uma demanda regional nos estudos dessas áreas, e busca oferecer formação pessoal de profissionais em diversas áreas como farmácia, química, veterinária, engenharias, medicina, biomedicina, biotecnologia, odontologia, entre outras. Até o momento já ocorreram 16 defesas de mestrado. O PPGBBio conta com a colaboração de docentes qualificados com experiência de orientação em cursos reconhecidos pela CAPES. Além disso, o programa possui infraestrutura administrativa adequada e diversos laboratórios para o desenvolvimento de pesquisas.